炭疽病是由炭疽桿菌引起的一種急性敗血症，在炭疽病常見的區域內，這種桿菌是很普遍的菌種，包括美國中南部。動物接觸到被污染土壤中的孢子後會感染炭疽病。動物可能會急性死亡，但如果觀察到症状，可以對其進行治療。診斷方法包括血液抹片和細菌培養。豬隻感染炭疽病後，可能會引起急性炭疽病，但通常會發展為局部的咽喉型，導致頭部和頸部腫大，進而引起機械性喉部阻塞。此外，馬感染炭疽病有時會表現出腹痛或疝氣。這是一種人畜共通的傳染病。
感染狂犬病的動物會出現多種臨床症狀。由於狂犬病是最重要的人畜共通疾病之一，在流行區域必須對此病保持高度警覺。診斷時必須由公共衛生單位進行病毒檢測。
許多螫蠅和廄刺蠅能引起皮膚損害。在受影響地區，毛髮會凸起，並出現小面積的水腫，當毛髮被分開時，可能會看到結痂。診斷依據蒼蠅過敏的病史。主要損害發生在馬的背部、胸部和腿部，以及狗的耳朵上。
操勞過度且延誤抗生素治療的動物，可能會發展成全身性的念珠菌感染症。診斷需要確認相關器官的損害。有口腔念珠菌症時，口腔會出現假膜性潰瘍性炎症，食道和胃的潰瘍則被稱為「鵝口瘡」。
雖然犬布魯氏桿菌是造成母狗流產的主要原因，但流產也可能由布魯氏桿菌病、β-溶血性鏈球菌、大腸桿菌、螺旋體和彎曲桿菌引起。已經有報告指出這些細菌會導致流產。細菌如大腸桿菌、鏈球菌和其他一些細菌，有時會在流產的母貓胎兒中被發現。診斷方法是透過對流產胎兒的培養進行檢測。
貓咪在頸背側、雙側肩胛骨之間、胸腔背側、後肢、以及軀幹後腰區背部，可能會發生軟組織肉瘤。這些部位都是常見的疫苗注射部位，且已有科學證據證實這些肉瘤的發生與疫苗注射有關。發生的腫瘤種類包括纖維肉瘤、惡性纖維組織瘤、骨肉瘤、橫紋肌肉瘤、脂肪肉瘤和軟骨肉瘤。診斷方式需要檢驗腫瘤的種類並評估其生長部位。已有一些證據推測，狗也可能像貓咪一樣在注射部位發生肉瘤。
在熱帶氣候中，由格蘭氏陰性芽孢桿菌——假性鼻疽伯克霍爾德氏菌（Burkholderia pseudomallei）引起的敗血病可以得到改善。這種疾病可能是慢性或急性的，慢性徵候取決於病菌的位置和引起的膿瘡。診斷方法是通過培養菌來確定。這是一種動物生理學的疾病。
結紮的馬匹如果傷口被金黃色葡萄球菌感染，可能會導致精索慢性腫大變硬。在腫塊內會有許多小膿包，可以進行採樣作細菌培養。也有報告指出，金黃色葡萄球菌在馬與小動物的其他部位會引起結節樣的皮膚病，伴隨潰瘍，還可能生成廔管，但這樣的病例很罕見。
伺機性霉菌感染在家畜動物中較為罕見，這種感染是由細胞壁含有黑色素或類似黑色素的霉菌引起的。馬匹在毛髮完整的皮膚上會產生結節，或在身體多處出現直徑1-3公分的脫毛斑或膿泡。而犬貓則會出現皮下結節，這些結節可能很乾燥，或伴隨潰瘍、發紅或壞死。也有系統性伺機性霉菌感染的報告。診斷方法是通過霉菌培養和組織學檢查。
犬貓的蘇拉病是由錐蟲（Trypanosoma evansi）引起的，常見於熱帶或亞熱帶地區，也可能由布氏錐蟲（T. brucei）引起，在狗中還可能由剛果錐蟲（T. congolense）引起，死亡率達百分之百。死後變化：可以在所有的組織及體液中發現錐蟲，通過吸血的節肢動物傳播。
幾種壁蝨會攻擊所有家畜，並且有可能作為疾病的傳播媒介。診斷通常是通過在皮膚上發現壁蝨來進行。
兼性蠅蛆病是指組織寄生物的蛆幼蟲侵入組織。典型的飛蟲類包括家蠅屬（MUSCA）、綠頭蒼蠅屬（CALLIPHORA）、銀頭蒼蠅屬（PHAENICIA）、銀蒼蠅屬（LUCILIA）、鉛色蒼蠅屬（PHORMIA）和肉蒼蠅屬（SARCOPHAGA）。綠頭蒼蠅（Calliphorine）蠅蛆病在綿羊中尤為重要，並被稱為綿羊殺手。診斷通常是通過在傷口中鑑定蛆來進行。需要區分螺旋蛆在組織中的危害與其寄生的情況。
