雖然犬布魯氏桿菌是造成母狗流產的主要原因，但流產也可能由布魯氏桿菌病、β-溶血性鏈球菌、大腸桿菌、螺旋體和彎曲桿菌引起。已經有報告指出這些細菌會導致流產。細菌如大腸桿菌、鏈球菌和其他一些細菌，有時會在流產的母貓胎兒中被發現。診斷方法是透過對流產胎兒的培養進行檢測。
任何動物都有可能天生缺乏子宮角，但即使子宮角缺失，仍有可能懷孕。這種情況可通過理學檢查、影像學檢查、外科手術或驗屍等方式進行診斷。
子宮管阻塞會導致所有動物的繁殖障礙。生前診斷較為困難，但可通過外科手術，如沖洗子宮管來治療。超排卵和胚胎收集可以幫助檢測通暢性。大動物可能會出現可觸診的症狀。阻塞可能由囊腫或子宮管感染引起。
缺乏子宮或子宮頸可能在任何情況下發生。液體會積聚在缺陷部位的顱內。這可以通過觸診、手術或屠宰來診斷。在牛隻中，這種情況被稱為「白色小牛疾病」，因為它通常發生在白色牛中，但不僅限於這一品種。當陰道發育不完全或處女膜無孔時，裡急後重會伴隨自然生長的情況發生。在小型動物的X光片上，可以看到子宮內充滿液體，並且看起來像子宮積膿。
懷孕期間通常不會發情，直到小貓被斷奶為止。不過，產後7到10天內，動情期是有可能發生的。大多數母貓會在斷奶後的3到4周進入動情期。哺乳期間通常不會發情，卵巢上也不會出現黃體，儘管偶爾會有母豬在生下小豬後的3到5天內顯示出精神性動情期。哺乳的母牛可能呈現非週期性發情。
睪丸退化會導致精液的質量或數量減少，這種情況可發生於所有物種，通常與睪丸的病變有關，例如：寒冷、創傷、毒性、發燒和年齡等因素。發病歷史需要與先天性發育不全區分開來。觸診睪丸時可能會發現音調減少或增加。超音波檢查對診斷具有一定價值。
睪丸雌性化的併發症狀包括男性遺傳型、女性遺傳表型和腹部睪丸。這些個體通常表現出像男性一樣的侵略性行為。
有些雄性動物的睪丸異常較小，且與不育有關。診斷通常透過睪丸觸診和測量結果進行。這種情況可以是單側或雙側的。觀察許多品種的動物後，認為這可能是遺傳性因素所致。染色體異常，例如XXY型（克萊恩費爾特綜合症），有時會被發現。
子宮無力是指在分娩期間或分娩後，子宮缺乏正常的生理收縮。它可能是由以下因素引起的，並導致難產、水腫或低血鈣症等疾病。
子宮脫垂在母馬、母狗和母貓中較為罕見，通常發生在分娩後不久。在狗和貓中，當胚胎仍留在子宮內時，子宮角可能會發生脫垂。
脫腸是指內臟通過臍部或腹股溝的管道突出至腹壁腔外。脫腸內容物可能包括腸道、網膜（位於胃上下緣懸掛的脂肪層）、子宮、膀胱或瘤胃。診斷通常通過觸診疝氣囊來進行。這種情況通常由創傷或小切口所引起。這個缺陷在西班牙長耳獵犬幼犬中已有明顯發現，並且是其他缺陷之一。腹部受到壓迫，尤其是疝氣，會引起疼痛並可能導致嚴重的併發症。
因為生殖器官無法正常發育而導致不孕的母馬，通常會有異常的性染色體數目。這些母馬的基因組中只有63個染色體，僅擁有一個X染色體，缺乏另一個性染色體（XO）。也有些母馬雖然表現出雌性特徵，但其基因型卻是XY染色體。這類情況需要通過核型分析進行診斷。XO基因型的動物通常卵巢較小，體型也較為矮小。這些動物的血漿中促黃體素濃度通常較高，但雌激素和黃體素濃度則較低。染色體異常也是造成牛、豬、綿羊、貓和狗不孕的原因之一。
