雖然犬布魯氏桿菌是造成母狗流產的主要原因，但流產也可能由布魯氏桿菌病、β-溶血性鏈球菌、大腸桿菌、螺旋體和彎曲桿菌引起。已經有報告指出這些細菌會導致流產。細菌如大腸桿菌、鏈球菌和其他一些細菌，有時會在流產的母貓胎兒中被發現。診斷方法是透過對流產胎兒的培養進行檢測。
任何動物都有可能天生缺乏子宮角，但即使子宮角缺失，仍有可能懷孕。這種情況可通過理學檢查、影像學檢查、外科手術或驗屍等方式進行診斷。
子宮管阻塞會導致所有動物的繁殖障礙。生前診斷較為困難，但可通過外科手術，如沖洗子宮管來治療。超排卵和胚胎收集可以幫助檢測通暢性。大動物可能會出現可觸診的症狀。阻塞可能由囊腫或子宮管感染引起。
一隻習慣吃石灰石塊的狗出現了腎衰竭和高血鈣症的症狀。屍體解剖時發現，腎臟、肺臟、大動脈和心肌有擴散性的鈣化。這類似人類的鹼性乳症候群，一種由長期大量攝取碳酸鈣引起的情況。診斷是通過排除其他可能與過量鈣攝取相關的高血鈣症原因來確定的。
缺乏子宮或子宮頸可能在任何情況下發生。液體會積聚在缺陷部位的顱內。這可以通過觸診、手術或屠宰來診斷。在牛隻中，這種情況被稱為「白色小牛疾病」，因為它通常發生在白色牛中，但不僅限於這一品種。當陰道發育不完全或處女膜無孔時，裡急後重會伴隨自然生長的情況發生。在小型動物的X光片上，可以看到子宮內充滿液體，並且看起來像子宮積膿。
精蟲肉芽腫通常發生在副睪頭，是雄鹿和公羊不育的顯然可遺傳的原因，也已在公牛中報告過。這可能由於難以察覺的輸出細管所引起。通常發生在同型結合的脫毛公鹿身上。結實的肉芽腫通常可以通過觸診辨識。在公羊中，精蟲肉芽腫可能會進一步引發布氏桿菌感染，導致副睪炎，一些經培養的副睪炎陰性案例被認為與精液有關。精蟲肉芽腫也已在進行輸精管切除或受過外傷的狗中被報導（阿吉雷等人研究）。
睪丸退化會導致精液的質量或數量減少，這種情況可發生於所有物種，通常與睪丸的病變有關，例如：寒冷、創傷、毒性、發燒和年齡等因素。發病歷史需要與先天性發育不全區分開來。觸診睪丸時可能會發現音調減少或增加。超音波檢查對診斷具有一定價值。
睪丸雌性化的併發症狀包括男性遺傳型、女性遺傳表型和腹部睪丸。這些個體通常表現出像男性一樣的侵略性行為。
有些雄性動物的睪丸異常較小，且與不育有關。診斷通常透過睪丸觸診和測量結果進行。這種情況可以是單側或雙側的。觀察許多品種的動物後，認為這可能是遺傳性因素所致。染色體異常，例如XXY型（克萊恩費爾特綜合症），有時會被發現。
陰道結構異常，帶有傾斜的陰道層，可能導致尿液因次發性不育而外漏。診斷可通過體檢和陰道鏡檢查進行。此情況可能伴隨次發性陰道炎和子宮炎。
子宮無力是指在分娩期間或分娩後，子宮缺乏正常的生理收縮。它可能是由以下因素引起的，並導致難產、水腫或低血鈣症等疾病。
子宮脫垂在母馬、母狗和母貓中較為罕見，通常發生在分娩後不久。在狗和貓中，當胚胎仍留在子宮內時，子宮角可能會發生脫垂。
